Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP1P59025 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP1P59025 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP1P59025 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP1P59025 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP1P59025 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTP1P59025 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTP1P59025 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP1P59025 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP1P59025 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTP1P59025 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTP1P59025 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTP1P59025 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTP1P59025 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP1P59025 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP1P59025 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP1P59025 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP1P59025 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP1P59025 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP1P59025 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP1P59025 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP1P59025 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTP1P59025 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTP1P59025 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP1P59025 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP1P59025 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP1P59025 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP1P59025 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP1P59025 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP1P59025 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTP1P59025 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP1P59025 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP1P59025 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP1P59025 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP1P59025 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP1P59025 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP1P59025 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP1P59025 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP1P59025 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RTP1P59025 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP1P59025 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP1P59025 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms