Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROB1E7EW31 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms