Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NTRK2Q16620 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NTRK2Q16620 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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