Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U3KQA8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQA8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQA8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQA8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQA8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQA8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQA8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQA8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQA8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U3KQA8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U3KQA8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U3KQA8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
U3KQA8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
U3KQA8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
U3KQA8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U3KQA8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
U3KQA8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
U3KQA8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQA8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQA8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQA8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQA8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQA8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQA8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQA8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
U3KQA8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms