Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC61Q9Y6R9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC61Q9Y6R9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC61Q9Y6R9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC61Q9Y6R9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC61Q9Y6R9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC61Q9Y6R9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC61Q9Y6R9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms