Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB2Q9Y5G2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB2Q9Y5G2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB2Q9Y5G2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB2Q9Y5G2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB2Q9Y5G2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB2Q9Y5G2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHGB2Q9Y5G2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHGB2Q9Y5G2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHGB2Q9Y5G2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms