Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPREB3Q9UKI3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPREB3Q9UKI3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms