Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRG3Q99928 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms