Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC62Q6P9F0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC62Q6P9F0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC62Q6P9F0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms