Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPNMBQ14956 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPNMBQ14956 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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