Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RBPJQ06330 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RBPJQ06330 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBPJQ06330 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBPJQ06330 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBPJQ06330 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBPJQ06330 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBPJQ06330 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBPJQ06330 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBPJQ06330 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms