Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHLDA3Q9Y5J5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHLDA3Q9Y5J5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHLDA3Q9Y5J5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHLDA3Q9Y5J5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHLDA3Q9Y5J5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHLDA3Q9Y5J5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHLDA3Q9Y5J5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHLDA3Q9Y5J5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHLDA3Q9Y5J5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA3Q9Y5J5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA3Q9Y5J5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA3Q9Y5J5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA3Q9Y5J5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHLDA3Q9Y5J5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHLDA3Q9Y5J5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHLDA3Q9Y5J5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHLDA3Q9Y5J5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA3Q9Y5J5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA3Q9Y5J5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PHLDA3Q9Y5J5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHLDA3Q9Y5J5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA3Q9Y5J5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHLDA3Q9Y5J5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHLDA3Q9Y5J5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHLDA3Q9Y5J5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHLDA3Q9Y5J5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHLDA3Q9Y5J5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHLDA3Q9Y5J5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHLDA3Q9Y5J5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHLDA3Q9Y5J5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHLDA3Q9Y5J5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA3Q9Y5J5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA3Q9Y5J5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA3Q9Y5J5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHLDA3Q9Y5J5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHLDA3Q9Y5J5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA3Q9Y5J5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PHLDA3Q9Y5J5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PHLDA3Q9Y5J5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms