Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HCN4Q9Y3Q4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HCN4Q9Y3Q4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HCN4Q9Y3Q4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HCN4Q9Y3Q4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HCN4Q9Y3Q4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HCN4Q9Y3Q4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HCN4Q9Y3Q4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HCN4Q9Y3Q4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HCN4Q9Y3Q4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HCN4Q9Y3Q4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HCN4Q9Y3Q4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HCN4Q9Y3Q4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HCN4Q9Y3Q4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HCN4Q9Y3Q4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HCN4Q9Y3Q4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HCN4Q9Y3Q4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HCN4Q9Y3Q4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HCN4Q9Y3Q4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HCN4Q9Y3Q4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HCN4Q9Y3Q4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HCN4Q9Y3Q4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HCN4Q9Y3Q4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HCN4Q9Y3Q4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HCN4Q9Y3Q4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HCN4Q9Y3Q4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HCN4Q9Y3Q4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HCN4Q9Y3Q4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HCN4Q9Y3Q4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HCN4Q9Y3Q4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HCN4Q9Y3Q4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HCN4Q9Y3Q4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HCN4Q9Y3Q4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HCN4Q9Y3Q4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HCN4Q9Y3Q4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HCN4Q9Y3Q4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HCN4Q9Y3Q4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HCN4Q9Y3Q4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HCN4Q9Y3Q4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HCN4Q9Y3Q4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HCN4Q9Y3Q4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HCN4Q9Y3Q4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HCN4Q9Y3Q4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HCN4Q9Y3Q4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HCN4Q9Y3Q4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HCN4Q9Y3Q4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HCN4Q9Y3Q4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HCN4Q9Y3Q4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HCN4Q9Y3Q4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HCN4Q9Y3Q4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HCN4Q9Y3Q4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HCN4Q9Y3Q4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HCN4Q9Y3Q4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HCN4Q9Y3Q4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HCN4Q9Y3Q4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HCN4Q9Y3Q4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HCN4Q9Y3Q4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HCN4Q9Y3Q4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HCN4Q9Y3Q4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HCN4Q9Y3Q4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HCN4Q9Y3Q4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HCN4Q9Y3Q4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HCN4Q9Y3Q4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HCN4Q9Y3Q4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HCN4Q9Y3Q4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HCN4Q9Y3Q4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HCN4Q9Y3Q4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HCN4Q9Y3Q4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HCN4Q9Y3Q4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HCN4Q9Y3Q4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HCN4Q9Y3Q4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HCN4Q9Y3Q4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HCN4Q9Y3Q4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCN4Q9Y3Q4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCN4Q9Y3Q4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HCN4Q9Y3Q4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms