Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRQQ9UMZ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRQQ9UMZ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRQQ9UMZ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRQQ9UMZ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRQQ9UMZ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRQQ9UMZ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRQQ9UMZ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRQQ9UMZ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRQQ9UMZ3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRQQ9UMZ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRQQ9UMZ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRQQ9UMZ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRQQ9UMZ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRQQ9UMZ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRQQ9UMZ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRQQ9UMZ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRQQ9UMZ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRQQ9UMZ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRQQ9UMZ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRQQ9UMZ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms