Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDV3Q9UKY7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDV3Q9UKY7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDV3Q9UKY7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDV3Q9UKY7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDV3Q9UKY7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDV3Q9UKY7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDV3Q9UKY7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDV3Q9UKY7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDV3Q9UKY7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDV3Q9UKY7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDV3Q9UKY7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDV3Q9UKY7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDV3Q9UKY7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDV3Q9UKY7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDV3Q9UKY7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDV3Q9UKY7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDV3Q9UKY7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDV3Q9UKY7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDV3Q9UKY7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDV3Q9UKY7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDV3Q9UKY7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDV3Q9UKY7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDV3Q9UKY7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDV3Q9UKY7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDV3Q9UKY7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDV3Q9UKY7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDV3Q9UKY7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDV3Q9UKY7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDV3Q9UKY7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDV3Q9UKY7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDV3Q9UKY7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDV3Q9UKY7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDV3Q9UKY7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDV3Q9UKY7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDV3Q9UKY7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDV3Q9UKY7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDV3Q9UKY7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CDV3Q9UKY7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDV3Q9UKY7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDV3Q9UKY7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDV3Q9UKY7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDV3Q9UKY7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDV3Q9UKY7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CDV3Q9UKY7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDV3Q9UKY7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDV3Q9UKY7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDV3Q9UKY7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CDV3Q9UKY7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDV3Q9UKY7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDV3Q9UKY7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDV3Q9UKY7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDV3Q9UKY7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDV3Q9UKY7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDV3Q9UKY7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDV3Q9UKY7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDV3Q9UKY7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDV3Q9UKY7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDV3Q9UKY7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDV3Q9UKY7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDV3Q9UKY7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDV3Q9UKY7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDV3Q9UKY7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDV3Q9UKY7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDV3Q9UKY7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDV3Q9UKY7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDV3Q9UKY7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms