Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms