Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABI3Q9P2A4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABI3Q9P2A4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABI3Q9P2A4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABI3Q9P2A4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABI3Q9P2A4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABI3Q9P2A4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABI3Q9P2A4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABI3Q9P2A4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABI3Q9P2A4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABI3Q9P2A4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABI3Q9P2A4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABI3Q9P2A4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABI3Q9P2A4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABI3Q9P2A4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABI3Q9P2A4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABI3Q9P2A4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABI3Q9P2A4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABI3Q9P2A4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABI3Q9P2A4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABI3Q9P2A4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABI3Q9P2A4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABI3Q9P2A4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABI3Q9P2A4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABI3Q9P2A4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABI3Q9P2A4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABI3Q9P2A4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABI3Q9P2A4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABI3Q9P2A4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABI3Q9P2A4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABI3Q9P2A4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABI3Q9P2A4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABI3Q9P2A4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABI3Q9P2A4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABI3Q9P2A4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABI3Q9P2A4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABI3Q9P2A4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABI3Q9P2A4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABI3Q9P2A4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABI3Q9P2A4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABI3Q9P2A4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABI3Q9P2A4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABI3Q9P2A4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABI3Q9P2A4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABI3Q9P2A4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABI3Q9P2A4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABI3Q9P2A4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ABI3Q9P2A4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms