Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TMOD3Q9NYL9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TMOD3Q9NYL9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TMOD3Q9NYL9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
TMOD3Q9NYL9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TMOD3Q9NYL9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TMOD3Q9NYL9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TMOD3Q9NYL9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TMOD3Q9NYL9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TMOD3Q9NYL9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TMOD3Q9NYL9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TMOD3Q9NYL9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TMOD3Q9NYL9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TMOD3Q9NYL9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TMOD3Q9NYL9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TMOD3Q9NYL9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TMOD3Q9NYL9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TMOD3Q9NYL9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TMOD3Q9NYL9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TMOD3Q9NYL9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TMOD3Q9NYL9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TMOD3Q9NYL9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TMOD3Q9NYL9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TMOD3Q9NYL9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TMOD3Q9NYL9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TMOD3Q9NYL9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TMOD3Q9NYL9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TMOD3Q9NYL9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TMOD3Q9NYL9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TMOD3Q9NYL9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TMOD3Q9NYL9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TMOD3Q9NYL9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TMOD3Q9NYL9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TMOD3Q9NYL9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TMOD3Q9NYL9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TMOD3Q9NYL9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TMOD3Q9NYL9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TMOD3Q9NYL9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TMOD3Q9NYL9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TMOD3Q9NYL9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TMOD3Q9NYL9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TMOD3Q9NYL9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TMOD3Q9NYL9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TMOD3Q9NYL9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TMOD3Q9NYL9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TMOD3Q9NYL9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TMOD3Q9NYL9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TMOD3Q9NYL9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TMOD3Q9NYL9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TMOD3Q9NYL9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMOD3Q9NYL9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
TMOD3Q9NYL9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMOD3Q9NYL9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TMOD3Q9NYL9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TMOD3Q9NYL9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TMOD3Q9NYL9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TMOD3Q9NYL9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TMOD3Q9NYL9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMOD3Q9NYL9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMOD3Q9NYL9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMOD3Q9NYL9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TMOD3Q9NYL9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TMOD3Q9NYL9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TMOD3Q9NYL9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TMOD3Q9NYL9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TMOD3Q9NYL9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TMOD3Q9NYL9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TMOD3Q9NYL9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TMOD3Q9NYL9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMOD3Q9NYL9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMOD3Q9NYL9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TMOD3Q9NYL9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TMOD3Q9NYL9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TMOD3Q9NYL9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TMOD3Q9NYL9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TMOD3Q9NYL9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TMOD3Q9NYL9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TMOD3Q9NYL9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TMOD3Q9NYL9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TMOD3Q9NYL9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TMOD3Q9NYL9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms