Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COA4Q9NYJ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COA4Q9NYJ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COA4Q9NYJ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COA4Q9NYJ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COA4Q9NYJ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COA4Q9NYJ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COA4Q9NYJ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COA4Q9NYJ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COA4Q9NYJ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COA4Q9NYJ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COA4Q9NYJ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COA4Q9NYJ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COA4Q9NYJ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COA4Q9NYJ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COA4Q9NYJ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COA4Q9NYJ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA4Q9NYJ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA4Q9NYJ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COA4Q9NYJ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COA4Q9NYJ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COA4Q9NYJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COA4Q9NYJ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COA4Q9NYJ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COA4Q9NYJ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms