Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSD3Q9NYI0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PSD3Q9NYI0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSD3Q9NYI0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSD3Q9NYI0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSD3Q9NYI0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSD3Q9NYI0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSD3Q9NYI0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSD3Q9NYI0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSD3Q9NYI0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSD3Q9NYI0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSD3Q9NYI0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSD3Q9NYI0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSD3Q9NYI0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSD3Q9NYI0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSD3Q9NYI0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSD3Q9NYI0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSD3Q9NYI0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSD3Q9NYI0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSD3Q9NYI0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSD3Q9NYI0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSD3Q9NYI0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSD3Q9NYI0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSD3Q9NYI0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSD3Q9NYI0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSD3Q9NYI0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSD3Q9NYI0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSD3Q9NYI0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSD3Q9NYI0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSD3Q9NYI0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSD3Q9NYI0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSD3Q9NYI0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSD3Q9NYI0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSD3Q9NYI0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSD3Q9NYI0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSD3Q9NYI0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSD3Q9NYI0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSD3Q9NYI0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSD3Q9NYI0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSD3Q9NYI0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSD3Q9NYI0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSD3Q9NYI0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSD3Q9NYI0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSD3Q9NYI0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSD3Q9NYI0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSD3Q9NYI0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSD3Q9NYI0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSD3Q9NYI0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSD3Q9NYI0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSD3Q9NYI0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSD3Q9NYI0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSD3Q9NYI0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PSD3Q9NYI0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSD3Q9NYI0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSD3Q9NYI0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSD3Q9NYI0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms