Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)12.91□□□□□ -0.346e-8■■■■■ 55.7
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EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 55.7
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 55.7
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 55.7
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 310.83□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 55.7
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 29.86□□□□□ -0.836e-8■■■■■ 55.7
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 36.64□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 55.7
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EXOSC5Q9NQT4 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.193e-14■■■■■ 55.4
EXOSC5Q9NQT4 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.263e-14■■■■■ 55.4
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EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 54.8
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 54.8
EXOSC5Q9NQT4 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 39.55□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 54.8
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EXOSC5Q9NQT4 SNX13-206ENST00000474067 603 ntTSL 316.1■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 54.7
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EXOSC5Q9NQT4 SNX13-205ENST00000471744 454 ntTSL 412.27□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 54.7
EXOSC5Q9NQT4 SNX13-207ENST00000475800 507 ntTSL 412.27□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 54.7
EXOSC5Q9NQT4 SNX13-202ENST00000409604 4146 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 54.7
EXOSC5Q9NQT4 SNX13-208ENST00000482558 1139 ntTSL 27.21□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 54.7
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EXOSC5Q9NQT4 EIF4B-202ENST00000416762 1985 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 54.5
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EXOSC5Q9NQT4 EIF4B-207ENST00000549645 590 ntTSL 47.28□□□□□ -1.242e-9■■■■■ 54.5
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EXOSC5Q9NQT4 EIF4B-209ENST00000550390 871 ntTSL 57.02□□□□□ -1.292e-9■■■■■ 54.5
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EXOSC5Q9NQT4 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.312e-9■■■■■ 54.5
EXOSC5Q9NQT4 EIF4B-211ENST00000551002 537 ntTSL 45.43□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 54.5
EXOSC5Q9NQT4 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 54.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX13-201ENST00000409076 3818 ntTSL 27.43□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 54.2
EXOSC5Q9NQT4 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 54.2
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EXOSC5Q9NQT4 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 54.2
EXOSC5Q9NQT4 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.653e-7■■■■■ 54.2
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EXOSC5Q9NQT4 NPSR1-AS1-204ENST00000431669 369 ntTSL 1 (best)3.36□□□□□ -1.873e-7■■■■■ 54.2
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EXOSC5Q9NQT4 SOD2-204ENST00000401980 523 ntTSL 410.58□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 54.2
EXOSC5Q9NQT4 SOD2-214ENST00000545162 571 ntTSL 39.94□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 54.2
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EXOSC5Q9NQT4 STT3B-204ENST00000453168 1888 ntTSL 1 (best)22.09■■□□□ 1.133e-8■■■■■ 54.1
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EXOSC5Q9NQT4 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.633e-7■■■■■ 53.7
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EXOSC5Q9NQT4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 52.5
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EXOSC5Q9NQT4 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 510.63□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 52.5
EXOSC5Q9NQT4 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 52.5
EXOSC5Q9NQT4 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 58.87□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 52.5
EXOSC5Q9NQT4 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 52.5
EXOSC5Q9NQT4 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 52.5
EXOSC5Q9NQT4 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 52.3
EXOSC5Q9NQT4 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 52.3
EXOSC5Q9NQT4 WDR35-203ENST00000414212 3483 ntTSL 54.22□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 52.3
EXOSC5Q9NQT4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.526e-10■■■■■ 52
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-223ENST00000588516 1304 ntTSL 512.43□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-232ENST00000591579 144 ntTSL 1 (best)10.64□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-233ENST00000591989 233 ntTSL 39.72□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-218ENST00000587547 889 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-236ENST00000592846 484 ntTSL 45.7□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 51.9
EXOSC5Q9NQT4 NEDD4L-211ENST00000585363 241 ntTSL 55.24□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 51.9
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