Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.739e-19■■■■■ 193.2
EXOSC5Q9NQT4 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 212.95□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 172.7
EXOSC5Q9NQT4 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.24□□□□□ -1.736e-28■■■■■ 162.5
EXOSC5Q9NQT4 GPI-212ENST00000589985 1516 ntTSL 316.74■□□□□ 0.273e-10■■■■■ 143.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.024e-31■■■■■ 135.1
EXOSC5Q9NQT4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.894e-31■■■■■ 135.1
EXOSC5Q9NQT4 TMEM185A-209ENST00000612022 2178 ntTSL 217.16■□□□□ 0.344e-31■■■■■ 135.1
EXOSC5Q9NQT4 TMEM185A-203ENST00000502900 684 ntTSL 515.69■□□□□ 0.14e-31■■■■■ 135.1
EXOSC5Q9NQT4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -04e-31■■■■■ 135.1
EXOSC5Q9NQT4 TMEM185A-205ENST00000511776 283 ntTSL 511.51□□□□□ -0.574e-31■■■■■ 135.1
EXOSC5Q9NQT4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.661e-25■■■■■ 122.4
EXOSC5Q9NQT4 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 217.84■□□□□ 0.451e-25■■■■■ 122.4
EXOSC5Q9NQT4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.241e-25■■■■■ 122.4
EXOSC5Q9NQT4 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.321e-25■■■■■ 122.4
EXOSC5Q9NQT4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.371e-31■■■■■ 117.6
EXOSC5Q9NQT4 LITAF-219ENST00000576334 556 ntTSL 49.16□□□□□ -0.941e-31■■■■■ 117.6
EXOSC5Q9NQT4 LITAF-216ENST00000574848 554 ntTSL 48.8□□□□□ -11e-31■■■■■ 117.6
EXOSC5Q9NQT4 SLC22A6-206ENST00000540654 1778 ntTSL 511.98□□□□□ -0.491e-55■■■■■ 114.5
EXOSC5Q9NQT4 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.737e-23■■■■■ 105.5
EXOSC5Q9NQT4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.272e-27■■■■■ 100.4
EXOSC5Q9NQT4 ITGB5-207ENST00000481591 1202 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-27■■■■■ 100.4
EXOSC5Q9NQT4 ITGB5-209ENST00000488466 971 ntTSL 512.5□□□□□ -0.412e-27■■■■■ 100.4
EXOSC5Q9NQT4 ITGB5-203ENST00000461306 577 ntTSL 48.89□□□□□ -0.992e-27■■■■■ 100.4
EXOSC5Q9NQT4 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.45e-15■■■■■ 95.8
EXOSC5Q9NQT4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.16e-9■■■■■ 91.1
EXOSC5Q9NQT4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.156e-9■■■■■ 91.1
EXOSC5Q9NQT4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.186e-9■■■■■ 91.1
EXOSC5Q9NQT4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-16■■■■■ 87.8
EXOSC5Q9NQT4 ASIP-202ENST00000568305 610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-16■■■■■ 87.8
EXOSC5Q9NQT4 CKMT2-AS1-205ENST00000505295 909 ntTSL 29.51□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 74.8
EXOSC5Q9NQT4 CKMT2-AS1-201ENST00000500148 2224 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 74.8
EXOSC5Q9NQT4 CKMT2-AS1-204ENST00000503483 572 ntTSL 39□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 74.8
EXOSC5Q9NQT4 CKMT2-AS1-203ENST00000502041 2069 ntTSL 28.97□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 74.8
EXOSC5Q9NQT4 CKMT2-AS1-202ENST00000501927 2463 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 74.8
EXOSC5Q9NQT4 CKMT2-AS1-207ENST00000512287 601 ntTSL 27.72□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 74.8
EXOSC5Q9NQT4 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 74.8
EXOSC5Q9NQT4 PWAR5-201ENST00000624480 3180 ntBASIC7.69□□□□□ -1.187e-8■■■■■ 74.5
EXOSC5Q9NQT4 PPFIA1-225ENST00000638133 814 ntTSL 311.69□□□□□ -0.545e-19■■■■■ 74.4
EXOSC5Q9NQT4 PPFIA1-219ENST00000531657 3036 ntTSL 28.27□□□□□ -1.095e-19■■■■■ 74.4
EXOSC5Q9NQT4 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)7.68□□□□□ -1.185e-19■■■■■ 74.4
EXOSC5Q9NQT4 PPFIA1-215ENST00000530548 3774 ntTSL 26.78□□□□□ -1.325e-19■■■■■ 74.4
EXOSC5Q9NQT4 PPFIA1-204ENST00000525922 358 ntTSL 36.06□□□□□ -1.445e-19■■■■■ 74.4
EXOSC5Q9NQT4 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-19■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.21e-19■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.521e-19■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.591e-19■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.621e-19■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.631e-19■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 NOSTRIN-212ENST00000486873 594 ntTSL 32.93□□□□□ -1.941e-19■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 512.28□□□□□ -0.445e-24■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.775e-24■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 DLGAP4-AS1-204ENST00000559455 584 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.995e-24■■■■■ 72
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.61e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-217ENST00000602700 2533 ntTSL 217.77■□□□□ 0.441e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-218ENST00000602713 2606 ntTSL 217.52■□□□□ 0.41e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.381e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-203ENST00000366632 2525 ntTSL 217.22■□□□□ 0.351e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.341e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-219ENST00000602822 2691 ntTSL 217.14■□□□□ 0.341e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.341e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-201ENST00000295051 2706 ntTSL 216.82■□□□□ 0.281e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-207ENST00000422590 2939 ntTSL 1 (best)16.4■□□□□ 0.221e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 TSNAX-DISC1-203ENST00000602885 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.24□□□□□ -0.291e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.341e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 DISC1-211ENST00000535944 2940 ntTSL 210.6□□□□□ -0.711e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 TSNAX-DISC1-204ENST00000602956 3294 ntAPPRIS P5 TSL 210.4□□□□□ -0.741e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 TSNAX-DISC1-201ENST00000602567 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.13□□□□□ -0.791e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.861e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 TSNAX-DISC1-202ENST00000602634 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.65□□□□□ -0.871e-15■■■■■ 70.7
EXOSC5Q9NQT4 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-18■■■■■ 69
EXOSC5Q9NQT4 CCR1-201ENST00000296140 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.061e-35■■■■■ 69
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-208ENST00000474116 866 ntTSL 214.22□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 68.3
EXOSC5Q9NQT4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-9■■■■■ 67.6
EXOSC5Q9NQT4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-9■■■■■ 67.6
EXOSC5Q9NQT4 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 67.6
EXOSC5Q9NQT4 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.057e-7■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.256e-8■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-205ENST00000463426 893 ntTSL 321.47■■□□□ 1.036e-8■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 320.3■□□□□ 0.846e-8■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-210ENST00000494985 292 ntTSL 518.29■□□□□ 0.526e-8■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.466e-8■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.616e-8■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.936e-8■■■■■ 67.2
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-207ENST00000597081 1004 ntTSL 516.34■□□□□ 0.218e-19■■■■■ 67.1
EXOSC5Q9NQT4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 67
EXOSC5Q9NQT4 MAN1B1-201ENST00000371587 1485 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.786e-14■■■■■ 64.6
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-213ENST00000496670 645 ntTSL 52.8□□□□□ -1.969e-8■■■■■ 64.3
EXOSC5Q9NQT4 PCMTD2-201ENST00000266078 2371 ntTSL 210.23□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 64.1
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM1-202ENST00000477757 850 ntTSL 216.79■□□□□ 0.286e-15■■■■■ 64
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