Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVK-5Q9HDB9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ERVK-5Q9HDB9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVK-5Q9HDB9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVK-5Q9HDB9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ERVK-5Q9HDB9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ERVK-5Q9HDB9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERVK-5Q9HDB9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ERVK-5Q9HDB9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVK-5Q9HDB9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVK-5Q9HDB9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ERVK-5Q9HDB9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ERVK-5Q9HDB9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ERVK-5Q9HDB9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVK-5Q9HDB9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVK-5Q9HDB9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
ERVK-5Q9HDB9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ERVK-5Q9HDB9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ERVK-5Q9HDB9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVK-5Q9HDB9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVK-5Q9HDB9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ERVK-5Q9HDB9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ERVK-5Q9HDB9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ERVK-5Q9HDB9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVK-5Q9HDB9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVK-5Q9HDB9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVK-5Q9HDB9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERVK-5Q9HDB9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERVK-5Q9HDB9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERVK-5Q9HDB9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERVK-5Q9HDB9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERVK-5Q9HDB9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVK-5Q9HDB9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVK-5Q9HDB9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ERVK-5Q9HDB9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ERVK-5Q9HDB9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERVK-5Q9HDB9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVK-5Q9HDB9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERVK-5Q9HDB9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVK-5Q9HDB9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVK-5Q9HDB9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVK-5Q9HDB9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVK-5Q9HDB9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVK-5Q9HDB9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVK-5Q9HDB9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVK-5Q9HDB9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVK-5Q9HDB9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVK-5Q9HDB9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ERVK-5Q9HDB9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
ERVK-5Q9HDB9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVK-5Q9HDB9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVK-5Q9HDB9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVK-5Q9HDB9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVK-5Q9HDB9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVK-5Q9HDB9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERVK-5Q9HDB9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVK-5Q9HDB9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVK-5Q9HDB9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVK-5Q9HDB9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERVK-5Q9HDB9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERVK-5Q9HDB9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-5Q9HDB9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERVK-5Q9HDB9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ERVK-5Q9HDB9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVK-5Q9HDB9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms