Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMG9Q9H0W8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMG9Q9H0W8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMG9Q9H0W8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SMG9Q9H0W8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMG9Q9H0W8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG9Q9H0W8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG9Q9H0W8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG9Q9H0W8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMG9Q9H0W8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMG9Q9H0W8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMG9Q9H0W8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SMG9Q9H0W8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMG9Q9H0W8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMG9Q9H0W8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG9Q9H0W8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMG9Q9H0W8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMG9Q9H0W8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMG9Q9H0W8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMG9Q9H0W8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMG9Q9H0W8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMG9Q9H0W8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMG9Q9H0W8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMG9Q9H0W8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMG9Q9H0W8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMG9Q9H0W8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMG9Q9H0W8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMG9Q9H0W8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMG9Q9H0W8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMG9Q9H0W8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMG9Q9H0W8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMG9Q9H0W8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMG9Q9H0W8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMG9Q9H0W8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMG9Q9H0W8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMG9Q9H0W8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMG9Q9H0W8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMG9Q9H0W8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMG9Q9H0W8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMG9Q9H0W8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMG9Q9H0W8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMG9Q9H0W8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMG9Q9H0W8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMG9Q9H0W8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMG9Q9H0W8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMG9Q9H0W8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMG9Q9H0W8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMG9Q9H0W8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMG9Q9H0W8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMG9Q9H0W8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
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