Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SETD2Q9BYW2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD2Q9BYW2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SETD2Q9BYW2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD2Q9BYW2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SETD2Q9BYW2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SETD2Q9BYW2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD2Q9BYW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SETD2Q9BYW2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD2Q9BYW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD2Q9BYW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD2Q9BYW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD2Q9BYW2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD2Q9BYW2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD2Q9BYW2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD2Q9BYW2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD2Q9BYW2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD2Q9BYW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD2Q9BYW2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD2Q9BYW2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD2Q9BYW2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD2Q9BYW2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD2Q9BYW2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD2Q9BYW2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD2Q9BYW2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD2Q9BYW2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD2Q9BYW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD2Q9BYW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD2Q9BYW2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD2Q9BYW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD2Q9BYW2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD2Q9BYW2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD2Q9BYW2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD2Q9BYW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD2Q9BYW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD2Q9BYW2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD2Q9BYW2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD2Q9BYW2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD2Q9BYW2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD2Q9BYW2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SETD2Q9BYW2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD2Q9BYW2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD2Q9BYW2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD2Q9BYW2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SETD2Q9BYW2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD2Q9BYW2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD2Q9BYW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD2Q9BYW2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SETD2Q9BYW2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD2Q9BYW2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SETD2Q9BYW2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SETD2Q9BYW2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms