Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BBS2Q9BXC9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBS2Q9BXC9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBS2Q9BXC9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BBS2Q9BXC9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BBS2Q9BXC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BBS2Q9BXC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BBS2Q9BXC9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BBS2Q9BXC9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BBS2Q9BXC9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBS2Q9BXC9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BBS2Q9BXC9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BBS2Q9BXC9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BBS2Q9BXC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BBS2Q9BXC9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBS2Q9BXC9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BBS2Q9BXC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BBS2Q9BXC9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BBS2Q9BXC9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBS2Q9BXC9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBS2Q9BXC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBS2Q9BXC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BBS2Q9BXC9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BBS2Q9BXC9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BBS2Q9BXC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BBS2Q9BXC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BBS2Q9BXC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BBS2Q9BXC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BBS2Q9BXC9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BBS2Q9BXC9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BBS2Q9BXC9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BBS2Q9BXC9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BBS2Q9BXC9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBS2Q9BXC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BBS2Q9BXC9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BBS2Q9BXC9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BBS2Q9BXC9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BBS2Q9BXC9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BBS2Q9BXC9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BBS2Q9BXC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BBS2Q9BXC9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BBS2Q9BXC9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBS2Q9BXC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBS2Q9BXC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBS2Q9BXC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BBS2Q9BXC9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BBS2Q9BXC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BBS2Q9BXC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBS2Q9BXC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BBS2Q9BXC9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BBS2Q9BXC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BBS2Q9BXC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BBS2Q9BXC9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BBS2Q9BXC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BBS2Q9BXC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BBS2Q9BXC9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms