Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTP3Q9BQQ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTP3Q9BQQ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RTP3Q9BQQ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTP3Q9BQQ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTP3Q9BQQ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTP3Q9BQQ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTP3Q9BQQ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RTP3Q9BQQ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RTP3Q9BQQ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTP3Q9BQQ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTP3Q9BQQ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTP3Q9BQQ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RTP3Q9BQQ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTP3Q9BQQ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTP3Q9BQQ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTP3Q9BQQ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RTP3Q9BQQ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RTP3Q9BQQ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTP3Q9BQQ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTP3Q9BQQ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTP3Q9BQQ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTP3Q9BQQ7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTP3Q9BQQ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTP3Q9BQQ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTP3Q9BQQ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RTP3Q9BQQ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTP3Q9BQQ7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTP3Q9BQQ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTP3Q9BQQ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTP3Q9BQQ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTP3Q9BQQ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTP3Q9BQQ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTP3Q9BQQ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTP3Q9BQQ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTP3Q9BQQ7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTP3Q9BQQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RTP3Q9BQQ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTP3Q9BQQ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTP3Q9BQQ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTP3Q9BQQ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTP3Q9BQQ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTP3Q9BQQ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTP3Q9BQQ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTP3Q9BQQ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTP3Q9BQQ7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RTP3Q9BQQ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTP3Q9BQQ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RTP3Q9BQQ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RTP3Q9BQQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTP3Q9BQQ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RTP3Q9BQQ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RTP3Q9BQQ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RTP3Q9BQQ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTP3Q9BQQ7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTP3Q9BQQ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RTP3Q9BQQ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTP3Q9BQQ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTP3Q9BQQ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTP3Q9BQQ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTP3Q9BQQ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RTP3Q9BQQ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RTP3Q9BQQ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTP3Q9BQQ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTP3Q9BQQ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RTP3Q9BQQ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTP3Q9BQQ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RTP3Q9BQQ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RTP3Q9BQQ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTP3Q9BQQ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTP3Q9BQQ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RTP3Q9BQQ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RTP3Q9BQQ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTP3Q9BQQ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms