Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FAM83CQ9BQN1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FAM83CQ9BQN1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM83CQ9BQN1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAM83CQ9BQN1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FAM83CQ9BQN1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAM83CQ9BQN1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAM83CQ9BQN1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM83CQ9BQN1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM83CQ9BQN1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FAM83CQ9BQN1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM83CQ9BQN1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAM83CQ9BQN1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM83CQ9BQN1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAM83CQ9BQN1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAM83CQ9BQN1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM83CQ9BQN1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM83CQ9BQN1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM83CQ9BQN1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM83CQ9BQN1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM83CQ9BQN1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM83CQ9BQN1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM83CQ9BQN1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM83CQ9BQN1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM83CQ9BQN1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM83CQ9BQN1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM83CQ9BQN1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM83CQ9BQN1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM83CQ9BQN1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM83CQ9BQN1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM83CQ9BQN1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM83CQ9BQN1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM83CQ9BQN1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM83CQ9BQN1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM83CQ9BQN1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM83CQ9BQN1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM83CQ9BQN1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM83CQ9BQN1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM83CQ9BQN1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM83CQ9BQN1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM83CQ9BQN1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM83CQ9BQN1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM83CQ9BQN1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM83CQ9BQN1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM83CQ9BQN1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM83CQ9BQN1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM83CQ9BQN1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM83CQ9BQN1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM83CQ9BQN1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM83CQ9BQN1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM83CQ9BQN1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM83CQ9BQN1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM83CQ9BQN1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM83CQ9BQN1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FAM83CQ9BQN1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM83CQ9BQN1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM83CQ9BQN1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM83CQ9BQN1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM83CQ9BQN1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM83CQ9BQN1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM83CQ9BQN1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms