Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMSS1Q9BQ75 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMSS1Q9BQ75 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMSS1Q9BQ75 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CMSS1Q9BQ75 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMSS1Q9BQ75 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMSS1Q9BQ75 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMSS1Q9BQ75 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMSS1Q9BQ75 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMSS1Q9BQ75 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMSS1Q9BQ75 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMSS1Q9BQ75 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMSS1Q9BQ75 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMSS1Q9BQ75 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMSS1Q9BQ75 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMSS1Q9BQ75 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMSS1Q9BQ75 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMSS1Q9BQ75 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMSS1Q9BQ75 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMSS1Q9BQ75 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMSS1Q9BQ75 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMSS1Q9BQ75 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CMSS1Q9BQ75 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMSS1Q9BQ75 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMSS1Q9BQ75 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMSS1Q9BQ75 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMSS1Q9BQ75 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMSS1Q9BQ75 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMSS1Q9BQ75 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CMSS1Q9BQ75 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMSS1Q9BQ75 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMSS1Q9BQ75 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMSS1Q9BQ75 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMSS1Q9BQ75 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CMSS1Q9BQ75 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMSS1Q9BQ75 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMSS1Q9BQ75 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMSS1Q9BQ75 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMSS1Q9BQ75 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms