Protein–RNA interactions for Protein: Q99884

SLC6A7, Sodium-dependent proline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A7Q99884 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A7Q99884 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A7Q99884 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A7Q99884 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A7Q99884 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC6A7Q99884 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A7Q99884 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A7Q99884 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A7Q99884 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A7Q99884 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A7Q99884 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A7Q99884 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A7Q99884 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A7Q99884 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A7Q99884 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC6A7Q99884 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A7Q99884 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A7Q99884 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A7Q99884 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A7Q99884 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A7Q99884 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A7Q99884 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A7Q99884 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A7Q99884 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A7Q99884 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A7Q99884 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A7Q99884 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A7Q99884 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A7Q99884 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A7Q99884 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A7Q99884 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A7Q99884 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms