Protein–RNA interactions for Protein: Q99500

S1PR3, Sphingosine 1-phosphate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR3Q99500 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR3Q99500 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
S1PR3Q99500 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
S1PR3Q99500 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
S1PR3Q99500 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
S1PR3Q99500 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
S1PR3Q99500 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
S1PR3Q99500 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
S1PR3Q99500 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
S1PR3Q99500 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
S1PR3Q99500 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S1PR3Q99500 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
S1PR3Q99500 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR3Q99500 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR3Q99500 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR3Q99500 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR3Q99500 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR3Q99500 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR3Q99500 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR3Q99500 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR3Q99500 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR3Q99500 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S1PR3Q99500 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR3Q99500 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR3Q99500 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms