Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PANX3Q96QZ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PANX3Q96QZ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PANX3Q96QZ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PANX3Q96QZ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PANX3Q96QZ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PANX3Q96QZ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PANX3Q96QZ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PANX3Q96QZ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PANX3Q96QZ0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PANX3Q96QZ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PANX3Q96QZ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PANX3Q96QZ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PANX3Q96QZ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PANX3Q96QZ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PANX3Q96QZ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PANX3Q96QZ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PANX3Q96QZ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PANX3Q96QZ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PANX3Q96QZ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PANX3Q96QZ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PANX3Q96QZ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PANX3Q96QZ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PANX3Q96QZ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PANX3Q96QZ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PANX3Q96QZ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PANX3Q96QZ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PANX3Q96QZ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PANX3Q96QZ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PANX3Q96QZ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PANX3Q96QZ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PANX3Q96QZ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PANX3Q96QZ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PANX3Q96QZ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PANX3Q96QZ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PANX3Q96QZ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PANX3Q96QZ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PANX3Q96QZ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PANX3Q96QZ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PANX3Q96QZ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PANX3Q96QZ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PANX3Q96QZ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms