Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARXQ96QS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARXQ96QS3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARXQ96QS3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARXQ96QS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
ARXQ96QS3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARXQ96QS3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARXQ96QS3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARXQ96QS3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARXQ96QS3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARXQ96QS3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARXQ96QS3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARXQ96QS3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARXQ96QS3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARXQ96QS3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARXQ96QS3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ARXQ96QS3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ARXQ96QS3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARXQ96QS3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ARXQ96QS3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ARXQ96QS3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ARXQ96QS3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ARXQ96QS3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ARXQ96QS3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ARXQ96QS3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ARXQ96QS3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ARXQ96QS3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ARXQ96QS3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARXQ96QS3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARXQ96QS3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARXQ96QS3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARXQ96QS3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARXQ96QS3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ARXQ96QS3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARXQ96QS3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARXQ96QS3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARXQ96QS3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARXQ96QS3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARXQ96QS3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARXQ96QS3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARXQ96QS3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARXQ96QS3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARXQ96QS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARXQ96QS3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARXQ96QS3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ARXQ96QS3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ARXQ96QS3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ARXQ96QS3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARXQ96QS3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARXQ96QS3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARXQ96QS3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARXQ96QS3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ARXQ96QS3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
ARXQ96QS3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ARXQ96QS3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ARXQ96QS3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARXQ96QS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARXQ96QS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ARXQ96QS3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARXQ96QS3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARXQ96QS3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ARXQ96QS3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ARXQ96QS3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
ARXQ96QS3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ARXQ96QS3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARXQ96QS3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ARXQ96QS3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ARXQ96QS3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARXQ96QS3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ARXQ96QS3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARXQ96QS3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARXQ96QS3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARXQ96QS3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ARXQ96QS3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ARXQ96QS3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ARXQ96QS3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARXQ96QS3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARXQ96QS3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARXQ96QS3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms