Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB3IPQ96QF0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3IPQ96QF0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3IPQ96QF0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB3IPQ96QF0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB3IPQ96QF0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB3IPQ96QF0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB3IPQ96QF0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB3IPQ96QF0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAB3IPQ96QF0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3IPQ96QF0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB3IPQ96QF0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB3IPQ96QF0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB3IPQ96QF0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3IPQ96QF0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3IPQ96QF0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB3IPQ96QF0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB3IPQ96QF0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB3IPQ96QF0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RAB3IPQ96QF0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3IPQ96QF0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3IPQ96QF0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3IPQ96QF0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3IPQ96QF0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3IPQ96QF0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3IPQ96QF0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3IPQ96QF0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3IPQ96QF0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB3IPQ96QF0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3IPQ96QF0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB3IPQ96QF0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB3IPQ96QF0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB3IPQ96QF0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB3IPQ96QF0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB3IPQ96QF0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB3IPQ96QF0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB3IPQ96QF0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3IPQ96QF0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAB3IPQ96QF0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB3IPQ96QF0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB3IPQ96QF0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB3IPQ96QF0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB3IPQ96QF0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3IPQ96QF0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAB3IPQ96QF0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB3IPQ96QF0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3IPQ96QF0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3IPQ96QF0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB3IPQ96QF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB3IPQ96QF0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAB3IPQ96QF0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAB3IPQ96QF0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RAB3IPQ96QF0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB3IPQ96QF0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAB3IPQ96QF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3IPQ96QF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB3IPQ96QF0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB3IPQ96QF0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3IPQ96QF0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB3IPQ96QF0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms