Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC120Q96HB5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC120Q96HB5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms