Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC120Q96HB5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC120Q96HB5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC120Q96HB5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC120Q96HB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC120Q96HB5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC120Q96HB5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC120Q96HB5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC120Q96HB5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC120Q96HB5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC120Q96HB5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC120Q96HB5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC120Q96HB5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms