Protein–RNA interactions for Protein: Q96FL8

SLC47A1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A1Q96FL8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC47A1Q96FL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC47A1Q96FL8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC47A1Q96FL8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC47A1Q96FL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC47A1Q96FL8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC47A1Q96FL8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC47A1Q96FL8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC47A1Q96FL8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC47A1Q96FL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC47A1Q96FL8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC47A1Q96FL8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC47A1Q96FL8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC47A1Q96FL8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC47A1Q96FL8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC47A1Q96FL8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC47A1Q96FL8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC47A1Q96FL8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC47A1Q96FL8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC47A1Q96FL8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC47A1Q96FL8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC47A1Q96FL8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC47A1Q96FL8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC47A1Q96FL8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC47A1Q96FL8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC47A1Q96FL8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC47A1Q96FL8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC47A1Q96FL8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC47A1Q96FL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC47A1Q96FL8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC47A1Q96FL8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC47A1Q96FL8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC47A1Q96FL8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC47A1Q96FL8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC47A1Q96FL8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC47A1Q96FL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC47A1Q96FL8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC47A1Q96FL8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC47A1Q96FL8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC47A1Q96FL8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC47A1Q96FL8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC47A1Q96FL8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC47A1Q96FL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC47A1Q96FL8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC47A1Q96FL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC47A1Q96FL8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC47A1Q96FL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC47A1Q96FL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC47A1Q96FL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC47A1Q96FL8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC47A1Q96FL8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.8 ms