Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
OTUB2Q96DC9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OTUB2Q96DC9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
OTUB2Q96DC9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTUB2Q96DC9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
OTUB2Q96DC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
OTUB2Q96DC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTUB2Q96DC9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OTUB2Q96DC9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OTUB2Q96DC9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
OTUB2Q96DC9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
OTUB2Q96DC9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
OTUB2Q96DC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
OTUB2Q96DC9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
OTUB2Q96DC9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
OTUB2Q96DC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTUB2Q96DC9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
OTUB2Q96DC9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
OTUB2Q96DC9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OTUB2Q96DC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OTUB2Q96DC9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OTUB2Q96DC9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OTUB2Q96DC9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
OTUB2Q96DC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
OTUB2Q96DC9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
OTUB2Q96DC9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
OTUB2Q96DC9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
OTUB2Q96DC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
OTUB2Q96DC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
OTUB2Q96DC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
OTUB2Q96DC9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
OTUB2Q96DC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTUB2Q96DC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTUB2Q96DC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OTUB2Q96DC9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTUB2Q96DC9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTUB2Q96DC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OTUB2Q96DC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
OTUB2Q96DC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTUB2Q96DC9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OTUB2Q96DC9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OTUB2Q96DC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OTUB2Q96DC9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OTUB2Q96DC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
OTUB2Q96DC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
OTUB2Q96DC9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
OTUB2Q96DC9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
OTUB2Q96DC9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTUB2Q96DC9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OTUB2Q96DC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTUB2Q96DC9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTUB2Q96DC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTUB2Q96DC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OTUB2Q96DC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUB2Q96DC9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
OTUB2Q96DC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUB2Q96DC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUB2Q96DC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms