Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ZNF428Q96B54 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ZNF428Q96B54 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ZNF428Q96B54 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ZNF428Q96B54 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF428Q96B54 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ZNF428Q96B54 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ZNF428Q96B54 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ZNF428Q96B54 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ZNF428Q96B54 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZNF428Q96B54 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ZNF428Q96B54 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF428Q96B54 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ZNF428Q96B54 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF428Q96B54 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF428Q96B54 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF428Q96B54 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZNF428Q96B54 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ZNF428Q96B54 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF428Q96B54 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ZNF428Q96B54 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ZNF428Q96B54 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ZNF428Q96B54 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZNF428Q96B54 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ZNF428Q96B54 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF428Q96B54 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF428Q96B54 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF428Q96B54 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ZNF428Q96B54 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ZNF428Q96B54 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZNF428Q96B54 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ZNF428Q96B54 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZNF428Q96B54 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ZNF428Q96B54 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZNF428Q96B54 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF428Q96B54 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZNF428Q96B54 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZNF428Q96B54 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZNF428Q96B54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZNF428Q96B54 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF428Q96B54 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZNF428Q96B54 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZNF428Q96B54 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZNF428Q96B54 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF428Q96B54 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
ZNF428Q96B54 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ZNF428Q96B54 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF428Q96B54 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF428Q96B54 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF428Q96B54 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF428Q96B54 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF428Q96B54 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF428Q96B54 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF428Q96B54 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF428Q96B54 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF428Q96B54 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF428Q96B54 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF428Q96B54 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ZNF428Q96B54 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZNF428Q96B54 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF428Q96B54 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF428Q96B54 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZNF428Q96B54 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZNF428Q96B54 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ZNF428Q96B54 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZNF428Q96B54 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms