Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC38A4Q969I6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC38A4Q969I6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A4Q969I6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC38A4Q969I6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A4Q969I6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A4Q969I6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC38A4Q969I6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC38A4Q969I6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC38A4Q969I6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A4Q969I6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A4Q969I6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC38A4Q969I6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A4Q969I6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC38A4Q969I6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC38A4Q969I6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC38A4Q969I6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A4Q969I6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC38A4Q969I6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A4Q969I6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC38A4Q969I6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC38A4Q969I6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A4Q969I6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC38A4Q969I6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A4Q969I6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC38A4Q969I6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A4Q969I6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A4Q969I6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC38A4Q969I6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC38A4Q969I6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC38A4Q969I6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A4Q969I6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A4Q969I6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A4Q969I6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A4Q969I6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC38A4Q969I6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms