Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP13Q92995 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP13Q92995 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP13Q92995 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP13Q92995 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP13Q92995 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP13Q92995 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP13Q92995 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP13Q92995 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
USP13Q92995 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP13Q92995 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP13Q92995 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP13Q92995 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP13Q92995 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP13Q92995 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP13Q92995 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP13Q92995 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP13Q92995 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP13Q92995 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP13Q92995 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP13Q92995 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP13Q92995 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP13Q92995 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP13Q92995 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP13Q92995 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP13Q92995 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP13Q92995 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP13Q92995 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP13Q92995 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP13Q92995 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP13Q92995 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP13Q92995 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP13Q92995 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP13Q92995 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP13Q92995 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP13Q92995 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP13Q92995 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP13Q92995 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP13Q92995 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP13Q92995 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP13Q92995 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP13Q92995 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP13Q92995 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP13Q92995 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP13Q92995 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP13Q92995 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP13Q92995 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP13Q92995 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP13Q92995 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP13Q92995 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP13Q92995 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP13Q92995 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP13Q92995 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
USP13Q92995 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP13Q92995 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP13Q92995 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP13Q92995 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP13Q92995 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP13Q92995 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP13Q92995 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP13Q92995 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP13Q92995 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP13Q92995 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP13Q92995 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP13Q92995 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP13Q92995 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP13Q92995 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP13Q92995 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP13Q92995 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP13Q92995 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP13Q92995 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP13Q92995 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP13Q92995 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP13Q92995 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP13Q92995 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP13Q92995 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP13Q92995 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP13Q92995 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP13Q92995 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP13Q92995 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP13Q92995 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP13Q92995 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP13Q92995 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP13Q92995 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP13Q92995 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP13Q92995 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP13Q92995 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP13Q92995 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP13Q92995 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP13Q92995 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP13Q92995 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP13Q92995 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP13Q92995 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP13Q92995 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP13Q92995 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP13Q92995 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP13Q92995 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP13Q92995 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP13Q92995 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP13Q92995 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms