Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PROX1Q92786 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROX1Q92786 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROX1Q92786 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PROX1Q92786 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PROX1Q92786 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PROX1Q92786 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PROX1Q92786 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PROX1Q92786 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROX1Q92786 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PROX1Q92786 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROX1Q92786 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PROX1Q92786 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROX1Q92786 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PROX1Q92786 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROX1Q92786 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROX1Q92786 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PROX1Q92786 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PROX1Q92786 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PROX1Q92786 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PROX1Q92786 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PROX1Q92786 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PROX1Q92786 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROX1Q92786 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROX1Q92786 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PROX1Q92786 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PROX1Q92786 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROX1Q92786 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROX1Q92786 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX1Q92786 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROX1Q92786 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROX1Q92786 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROX1Q92786 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROX1Q92786 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROX1Q92786 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PROX1Q92786 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PROX1Q92786 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PROX1Q92786 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PROX1Q92786 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROX1Q92786 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms