Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TNRQ92752 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
TNRQ92752 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
TNRQ92752 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TNRQ92752 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
TNRQ92752 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
TNRQ92752 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TNRQ92752 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
TNRQ92752 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
TNRQ92752 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TNRQ92752 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TNRQ92752 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TNRQ92752 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
TNRQ92752 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
TNRQ92752 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
TNRQ92752 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TNRQ92752 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
TNRQ92752 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TNRQ92752 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
TNRQ92752 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
TNRQ92752 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TNRQ92752 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
TNRQ92752 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TNRQ92752 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
TNRQ92752 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
TNRQ92752 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
TNRQ92752 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TNRQ92752 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TNRQ92752 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TNRQ92752 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TNRQ92752 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
TNRQ92752 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TNRQ92752 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
TNRQ92752 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TNRQ92752 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TNRQ92752 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
TNRQ92752 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TNRQ92752 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TNRQ92752 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
TNRQ92752 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TNRQ92752 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
TNRQ92752 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
TNRQ92752 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TNRQ92752 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TNRQ92752 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TNRQ92752 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TNRQ92752 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
TNRQ92752 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TNRQ92752 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TNRQ92752 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TNRQ92752 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
TNRQ92752 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
TNRQ92752 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
TNRQ92752 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TNRQ92752 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TNRQ92752 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TNRQ92752 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
TNRQ92752 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TNRQ92752 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TNRQ92752 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TNRQ92752 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
TNRQ92752 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
TNRQ92752 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
TNRQ92752 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
TNRQ92752 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TNRQ92752 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TNRQ92752 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TNRQ92752 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TNRQ92752 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TNRQ92752 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TNRQ92752 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TNRQ92752 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
TNRQ92752 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
TNRQ92752 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TNRQ92752 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TNRQ92752 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
TNRQ92752 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TNRQ92752 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TNRQ92752 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TNRQ92752 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TNRQ92752 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TNRQ92752 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TNRQ92752 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TNRQ92752 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TNRQ92752 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TNRQ92752 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.66■■■■■ 4.1
TNRQ92752 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
TNRQ92752 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
TNRQ92752 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
TNRQ92752 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
TNRQ92752 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
TNRQ92752 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
TNRQ92752 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
TNRQ92752 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.57■■■■■ 4.08
TNRQ92752 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
TNRQ92752 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
TNRQ92752 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TNRQ92752 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TNRQ92752 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TNRQ92752 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms