Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX19Q92543 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX19Q92543 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX19Q92543 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX19Q92543 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX19Q92543 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX19Q92543 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX19Q92543 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX19Q92543 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNX19Q92543 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX19Q92543 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNX19Q92543 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX19Q92543 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX19Q92543 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SNX19Q92543 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNX19Q92543 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX19Q92543 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX19Q92543 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX19Q92543 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX19Q92543 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX19Q92543 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX19Q92543 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX19Q92543 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX19Q92543 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX19Q92543 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX19Q92543 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX19Q92543 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX19Q92543 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX19Q92543 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX19Q92543 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX19Q92543 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX19Q92543 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX19Q92543 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX19Q92543 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX19Q92543 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX19Q92543 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX19Q92543 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX19Q92543 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SNX19Q92543 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX19Q92543 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX19Q92543 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX19Q92543 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX19Q92543 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX19Q92543 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SNX19Q92543 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SNX19Q92543 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX19Q92543 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SNX19Q92543 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SNX19Q92543 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SNX19Q92543 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX19Q92543 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX19Q92543 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX19Q92543 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX19Q92543 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX19Q92543 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX19Q92543 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX19Q92543 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX19Q92543 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX19Q92543 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX19Q92543 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX19Q92543 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX19Q92543 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX19Q92543 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX19Q92543 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX19Q92543 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX19Q92543 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms