Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HERVK_113Q902F9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HERVK_113Q902F9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HERVK_113Q902F9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
HERVK_113Q902F9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
HERVK_113Q902F9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HERVK_113Q902F9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
HERVK_113Q902F9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HERVK_113Q902F9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HERVK_113Q902F9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HERVK_113Q902F9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HERVK_113Q902F9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HERVK_113Q902F9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
HERVK_113Q902F9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HERVK_113Q902F9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HERVK_113Q902F9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HERVK_113Q902F9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HERVK_113Q902F9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HERVK_113Q902F9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HERVK_113Q902F9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HERVK_113Q902F9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HERVK_113Q902F9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HERVK_113Q902F9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HERVK_113Q902F9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HERVK_113Q902F9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
HERVK_113Q902F9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HERVK_113Q902F9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HERVK_113Q902F9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HERVK_113Q902F9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HERVK_113Q902F9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HERVK_113Q902F9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HERVK_113Q902F9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HERVK_113Q902F9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
HERVK_113Q902F9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HERVK_113Q902F9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HERVK_113Q902F9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HERVK_113Q902F9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERVK_113Q902F9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERVK_113Q902F9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
HERVK_113Q902F9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
HERVK_113Q902F9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HERVK_113Q902F9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HERVK_113Q902F9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HERVK_113Q902F9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HERVK_113Q902F9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HERVK_113Q902F9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HERVK_113Q902F9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HERVK_113Q902F9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HERVK_113Q902F9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HERVK_113Q902F9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HERVK_113Q902F9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HERVK_113Q902F9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HERVK_113Q902F9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HERVK_113Q902F9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HERVK_113Q902F9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HERVK_113Q902F9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HERVK_113Q902F9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HERVK_113Q902F9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HERVK_113Q902F9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HERVK_113Q902F9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HERVK_113Q902F9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HERVK_113Q902F9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HERVK_113Q902F9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HERVK_113Q902F9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HERVK_113Q902F9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HERVK_113Q902F9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HERVK_113Q902F9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HERVK_113Q902F9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HERVK_113Q902F9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HERVK_113Q902F9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HERVK_113Q902F9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HERVK_113Q902F9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HERVK_113Q902F9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms