Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIN3Q8TB24 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RIN3Q8TB24 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIN3Q8TB24 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIN3Q8TB24 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIN3Q8TB24 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIN3Q8TB24 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIN3Q8TB24 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIN3Q8TB24 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIN3Q8TB24 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIN3Q8TB24 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIN3Q8TB24 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIN3Q8TB24 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIN3Q8TB24 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIN3Q8TB24 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RIN3Q8TB24 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RIN3Q8TB24 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RIN3Q8TB24 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIN3Q8TB24 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIN3Q8TB24 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIN3Q8TB24 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIN3Q8TB24 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIN3Q8TB24 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIN3Q8TB24 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIN3Q8TB24 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIN3Q8TB24 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIN3Q8TB24 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIN3Q8TB24 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIN3Q8TB24 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIN3Q8TB24 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIN3Q8TB24 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIN3Q8TB24 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RIN3Q8TB24 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIN3Q8TB24 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIN3Q8TB24 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIN3Q8TB24 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIN3Q8TB24 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIN3Q8TB24 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIN3Q8TB24 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIN3Q8TB24 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIN3Q8TB24 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIN3Q8TB24 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIN3Q8TB24 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIN3Q8TB24 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIN3Q8TB24 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIN3Q8TB24 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIN3Q8TB24 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIN3Q8TB24 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIN3Q8TB24 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIN3Q8TB24 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RIN3Q8TB24 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RIN3Q8TB24 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIN3Q8TB24 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIN3Q8TB24 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RIN3Q8TB24 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIN3Q8TB24 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIN3Q8TB24 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIN3Q8TB24 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIN3Q8TB24 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIN3Q8TB24 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIN3Q8TB24 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIN3Q8TB24 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIN3Q8TB24 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIN3Q8TB24 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIN3Q8TB24 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RIN3Q8TB24 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIN3Q8TB24 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RIN3Q8TB24 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIN3Q8TB24 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms