Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC24A4Q8NFF2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC24A4Q8NFF2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC24A4Q8NFF2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC24A4Q8NFF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A4Q8NFF2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC24A4Q8NFF2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC24A4Q8NFF2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC24A4Q8NFF2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC24A4Q8NFF2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A4Q8NFF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC24A4Q8NFF2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A4Q8NFF2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC24A4Q8NFF2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC24A4Q8NFF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC24A4Q8NFF2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC24A4Q8NFF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC24A4Q8NFF2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC24A4Q8NFF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A4Q8NFF2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A4Q8NFF2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC24A4Q8NFF2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A4Q8NFF2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC24A4Q8NFF2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A4Q8NFF2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC24A4Q8NFF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC24A4Q8NFF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC24A4Q8NFF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A4Q8NFF2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A4Q8NFF2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A4Q8NFF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC24A4Q8NFF2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC24A4Q8NFF2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC24A4Q8NFF2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC24A4Q8NFF2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC24A4Q8NFF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC24A4Q8NFF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms