Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC150Q8NCX0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC150Q8NCX0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC150Q8NCX0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC150Q8NCX0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC150Q8NCX0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC150Q8NCX0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC150Q8NCX0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC150Q8NCX0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC150Q8NCX0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC150Q8NCX0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC150Q8NCX0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC150Q8NCX0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC150Q8NCX0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC150Q8NCX0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC150Q8NCX0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC150Q8NCX0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC150Q8NCX0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC150Q8NCX0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC150Q8NCX0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC150Q8NCX0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC150Q8NCX0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC150Q8NCX0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC150Q8NCX0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC150Q8NCX0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC150Q8NCX0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC150Q8NCX0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC150Q8NCX0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC150Q8NCX0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC150Q8NCX0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC150Q8NCX0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC150Q8NCX0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC150Q8NCX0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC150Q8NCX0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC150Q8NCX0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC150Q8NCX0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC150Q8NCX0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC150Q8NCX0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC150Q8NCX0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC150Q8NCX0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC150Q8NCX0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC150Q8NCX0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC150Q8NCX0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC150Q8NCX0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC150Q8NCX0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC150Q8NCX0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC150Q8NCX0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC150Q8NCX0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC150Q8NCX0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC150Q8NCX0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC150Q8NCX0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC150Q8NCX0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC150Q8NCX0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC150Q8NCX0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC150Q8NCX0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC150Q8NCX0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC150Q8NCX0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC150Q8NCX0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC150Q8NCX0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms