Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNPLA1Q8N8W4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNPLA1Q8N8W4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PNPLA1Q8N8W4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNPLA1Q8N8W4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNPLA1Q8N8W4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNPLA1Q8N8W4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNPLA1Q8N8W4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNPLA1Q8N8W4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNPLA1Q8N8W4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNPLA1Q8N8W4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNPLA1Q8N8W4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNPLA1Q8N8W4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNPLA1Q8N8W4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNPLA1Q8N8W4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNPLA1Q8N8W4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNPLA1Q8N8W4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNPLA1Q8N8W4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNPLA1Q8N8W4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNPLA1Q8N8W4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNPLA1Q8N8W4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNPLA1Q8N8W4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNPLA1Q8N8W4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNPLA1Q8N8W4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNPLA1Q8N8W4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNPLA1Q8N8W4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNPLA1Q8N8W4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNPLA1Q8N8W4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNPLA1Q8N8W4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms