Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5P1

ZC3H8, Zinc finger CCCH domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 517.04■□□□□ 0.329e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.169e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.119e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.19e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 515.13■□□□□ 0.019e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-212ENST00000638230 1922 ntTSL 512.27□□□□□ -0.459e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-221ENST00000639824 1450 ntTSL 511.4□□□□□ -0.589e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 59.99□□□□□ -0.819e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-202ENST00000366525 2851 ntTSL 59.86□□□□□ -0.839e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-216ENST00000638716 2640 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.869e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.979e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-222ENST00000639880 4239 ntTSL 58.97□□□□□ -0.979e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.19e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-207ENST00000468690 5273 ntTSL 58.01□□□□□ -1.139e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-213ENST00000638301 3650 ntTSL 56.77□□□□□ -1.339e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-220ENST00000639667 3940 ntTSL 26□□□□□ -1.459e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 HNRNPU-210ENST00000483966 1069 ntTSL 24.47□□□□□ -1.699e-9■■■■■ 38.6
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.182e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-207ENST00000536012 2447 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.222e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.32e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-214ENST00000543225 2407 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.332e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 26.49□□□□□ -1.372e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.372e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-213ENST00000541012 2432 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.392e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-205ENST00000483264 487 ntTSL 56.06□□□□□ -1.442e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 24.21□□□□□ -1.742e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)3.99□□□□□ -1.772e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.942e-14■■■■■ 38.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-208ENST00000419681 644 ntTSL 516.28■□□□□ 0.24e-10■■■■■ 37.8
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-217ENST00000492298 591 ntTSL 510.41□□□□□ -0.744e-10■■■■■ 37.8
ZC3H8Q8N5P1 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.364e-10■■■■■ 37.8
ZC3H8Q8N5P1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.421e-11■■■■■ 37.3
ZC3H8Q8N5P1 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-11■■■■■ 37.3
ZC3H8Q8N5P1 RPS13-203ENST00000525828 664 ntTSL 217.02■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 36.4
ZC3H8Q8N5P1 RPS13-204ENST00000526895 561 ntTSL 314.35□□□□□ -0.111e-10■■■■■ 36.4
ZC3H8Q8N5P1 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.741e-10■■■■■ 36.4
ZC3H8Q8N5P1 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.941e-10■■■■■ 36.4
ZC3H8Q8N5P1 RPS13-208ENST00000531908 746 ntTSL 26.04□□□□□ -1.441e-10■■■■■ 36.4
ZC3H8Q8N5P1 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.11□□□□□ -1.916e-10■■■■■ 36.3
ZC3H8Q8N5P1 ACADM-211ENST00000528016 546 ntTSL 418.02■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 36.1
ZC3H8Q8N5P1 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.761e-8■■■■■ 36.1
ZC3H8Q8N5P1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.282e-10■■■■■ 35.6
ZC3H8Q8N5P1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 35.6
ZC3H8Q8N5P1 UFD1-206ENST00000466373 3059 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-10■■■■■ 35.6
ZC3H8Q8N5P1 UFD1-205ENST00000459854 5038 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.812e-10■■■■■ 35.6
ZC3H8Q8N5P1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.632e-8■■■■■ 35.6
ZC3H8Q8N5P1 NOP56-208ENST00000467857 735 ntTSL 29.21□□□□□ -0.944e-14■■■■■ 35.4
ZC3H8Q8N5P1 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.414e-14■■■■■ 35.4
ZC3H8Q8N5P1 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 35
ZC3H8Q8N5P1 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 211.35□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 34.4
ZC3H8Q8N5P1 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 34.4
ZC3H8Q8N5P1 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 34.4
ZC3H8Q8N5P1 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.838e-7■■■■■ 34.4
ZC3H8Q8N5P1 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 34.4
ZC3H8Q8N5P1 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 35.38□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 34.4
ZC3H8Q8N5P1 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 35.87□□□□□ -1.473e-19■■■■■ 34.3
ZC3H8Q8N5P1 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.823e-19■■■■■ 34.3
ZC3H8Q8N5P1 SNHG26-201ENST00000415611 1099 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.818e-15■■■■■ 34.3
ZC3H8Q8N5P1 SNHG26-202ENST00000422542 1106 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -18e-15■■■■■ 34.3
ZC3H8Q8N5P1 SNHG26-203ENST00000432668 574 ntTSL 36.73□□□□□ -1.338e-15■■■■■ 34.3
ZC3H8Q8N5P1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.238e-15■■■■■ 34.3
ZC3H8Q8N5P1 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 33.9
ZC3H8Q8N5P1 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 220.68■□□□□ 0.92e-14■■■■■ 33.4
ZC3H8Q8N5P1 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.242e-14■■■■■ 33.4
ZC3H8Q8N5P1 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.56□□□□□ -1.682e-18■■■■■ 33.4
ZC3H8Q8N5P1 SNORD91B-201ENST00000391250 95 nt3.58□□□□□ -1.842e-18■■■■■ 33.4
ZC3H8Q8N5P1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -09e-7■■■■■ 33.1
ZC3H8Q8N5P1 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 33.1
ZC3H8Q8N5P1 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 39.82□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 33.1
ZC3H8Q8N5P1 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.179e-7■■■■■ 33.1
ZC3H8Q8N5P1 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 56.39□□□□□ -1.399e-7■■■■■ 33.1
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.672e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.632e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 213.36□□□□□ -0.272e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.362e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 510.86□□□□□ -0.672e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.892e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.922e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.052e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.052e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 38.17□□□□□ -1.12e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.182e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.262e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.632e-12■■■■■ 33
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.323e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.463e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.633e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.633e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.713e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 210.09□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-211ENST00000464645 560 ntTSL 48.96□□□□□ -0.983e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 57.89□□□□□ -1.153e-10■■■■■ 32.5
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-207ENST00000507660 550 ntTSL 310.21□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 32.1
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-212ENST00000513581 683 ntTSL 210.02□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 32.1
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-206ENST00000505028 552 ntTSL 46.89□□□□□ -1.312e-9■■■■■ 32.1
ZC3H8Q8N5P1 THAP9-AS1-203ENST00000504718 573 ntTSL 46.65□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 32.1
ZC3H8Q8N5P1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-34■■■■■ 31.9
ZC3H8Q8N5P1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.572e-34■■■■■ 31.9
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