Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIMKLAQ8IXN7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIMKLAQ8IXN7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIMKLAQ8IXN7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIMKLAQ8IXN7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIMKLAQ8IXN7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIMKLAQ8IXN7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIMKLAQ8IXN7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIMKLAQ8IXN7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIMKLAQ8IXN7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIMKLAQ8IXN7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIMKLAQ8IXN7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIMKLAQ8IXN7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIMKLAQ8IXN7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIMKLAQ8IXN7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms